Beschreibung.
Das Ion Personal Genome Machine (PGM) System verbindet Halbleiter-Sequenzierungstechnologie mit natürlicher Biochemie, um chemische Informationen direkt in digitale Daten zu übersetzen und die Sequenzierung damit für Ihr Labor zugänglich zu machen.
Dieses etablierte System nutzt die exponentiellen Verbesserungen in der Halbleiterindustrie (bekannt als Moores Gesetz), um Skalierbarkeit und Flexibilität für verschiedene Anwendungen zu bieten.
Das Ion PGM System verwendet natürliche Sequenzierungschemie, die die Notwendigkeit teurer Optiken eliminiert und komplexe Chemien zur Messung natürlicher DNA-Erweiterung reduziert.
Das System nutzt direkte, Echtzeit-Sequenzierungserkennung und liefert in der Regel Ergebnisse innerhalb von 3–7 Stunden.
CPU: Zwei 6-Kern 2,66 GHz CPUs.
Kapazität: 1 Chip pro Lauf.
Chip-Kompatibilität: Ion 314 Chip v2 BC, Ion 316 Chip v2 BC, Ion 318 Chip v2 BC.
Aktueller Grenzwert: 6.
7 A (max).
Datenausgabe: BAM-Dateien, FASTQ-Dateien, SFF-Dateien, VCF-Dateien.
Display-Schnittstelle: Touchscreen-Benutzeroberfläche.
Externer Computer: Torrent Server.
Hochdurchsatzkompatibilität: Hochdurchsatzkompatibel, Multiplexing.
Speicher des Instruments: 48 GB RAM, acht 2 TB Festplatten im RAID 5.
Betriebssystem: Ubuntu 10.
04.
Ausgabe: Ion 314 Chip v2: Bis zu 100 Mb, Ion 316 Chip v2: Bis zu 1 Gb, Ion 318 Chip v2: Bis zu 2 Gb.
Auslesen pro Lauf: Ion 314 Chip v2: 400.
000-500.
000, Ion 316 Chip v2: 2-3 Millionen, Ion 318 Chip v2: 4-5,5 Millionen.
Laufzeit: Ion 314 Chip v2: 2,3 bis 3,7 Stunden, Ion 316 Chip v2: 3,0 bis 4,9 Stunden, Ion 318 Chip v2: 4,4 bis 7,3 Stunden.
Sequenzierungsskala: 3 Mb bis 2 Gb.
Technik: Post-Licht Ion Halbleiter Sequenzierung.
Durchsatz: Bis zu 2 Gb pro Lauf.
Spannungsgrenze: 100 V (min) bis 240 V (max).
Abmessungen (H x B x T): 530 x 240 x 200 mm.
Gewicht: 30 kg.
Das Ion OneTouch 2 System führt Template-Amplifikation und -Anreicherung als Teil des manuellen Arbeitsablaufs für die Ion PGM-, Ion Proton- und Ion S5- und Ion S5 XL-Systeme durch.
Es bietet skalierbare Template-Vorbereitung für alle Ion-Halbleiterchips.
Mit seinem kleinen Platzbedarf passt das System problemlos auf jede Werkbank.
Das Ion OneTouch 2 System integriert mehrere manuelle Template-Vorbereitungsschritte in ein einziges System.
Dies ermöglicht die parallele Bearbeitung mehrerer Proben pro Tag durch modulares Design.
Es ist flexibel und unterstützt skalierbare Template-Vorbereitung für alle Ion-Halbleiter-Sequenzierungschips mit bis zu 400 Basen auf den Ion 520/530-Chips, bis zu 200 Basen auf dem Ion 540-Chip, bis zu 400 Basen auf dem Ion PGM-System und bis zu 200 Basen auf dem Ion Proton-System.
Der Bedarf an Gas entfällt durch den Einsatz einer peristaltischen Pumpe.
Chip-Kompatibilität: Ion 314 Chip, Ion 316 Chip, Ion 318 Chip, Ion PI Chip.
Hochdurchsatzkompatibilität: Automatisierte Protokolle, Hochdurchsatzkompatibel, Multiplexing.
Bibliothekstyp: Fragmentbibliothek, Mate-Paired-Bibliothek, zielgerichtete Sequenzierungsbibliothek, cDNA-Bibliothek.
Multiplex-Fähigkeit: Bis zu 384 codierte Bibliotheken.
Laufzeit: Hands-on-Zeit: Minuten, Ion PGM System: 5 Stunden insgesamt für die Template-Vorbereitung